โคนันและเพื่อนๆ พร้อมด้วยผู้ช่วยครูประจำชั้น วากาสะ ค้นพบโครงกระดูกในโรงเก็บของเก่าที่โรงเรียน เหยื่อเสียชีวิตเมื่อประมาณสิบปีก่อน เมื่อสิบปีที่แล้ว กลุ่มโจรสี่คนบุกเข้าไปในบ้านของชายผู้มั่งคั่งและหลบหนีไปพร้อมกับแท่งทองคำมูลค่า 200 ล้านเยน ในคืนเดียวกันนั้น มีผู้เห็นบุคคลต้องสงสัยกลุ่มหนึ่งเข้ามาในโรงเรียนประถมศึกษาเทตัน โคนันและเพื่อนๆ พยายามถอดรหัสรหัสที่เขียนบนผ้าคาดศีรษะที่พบในมือโครงกระดูก โคนันตระหนักได้ว่าตารางเรียนที่อายูมิที่พบในโรงเก็บของคือกุญแจสำคัญในการถอดรหัส