สำนักงานนักสืบของโคโกโร่ได้รับโทรศัพท์ลึกลับ มีคนในอีกด้านหนึ่งเตือนเรื่องระเบิดและทิ้งรหัสไว้ “เด็กชายในชุดน้ำเงินและม้าลายสีฟ้า ฝนจากเบื้องบน …” ถ้าโคนันถอดรหัสปริศนาได้ เขาก็สามารถหยุดระเบิดได้ การผจญภัยเริ่มต้นขึ้นสำหรับโคนันและเหล่านักสืบหนุ่ม ที่เกิดขึ้นในการแข่งขันฟุตบอลระหว่างฮิเดโอะ อาคางิจากทีมสปิริตโตเกียวและริวสุเกะ ฮิโกะจากบิ๊กโอซาก้า